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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
19/01/2011 |
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Data da última atualização: |
03/06/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SILLA, P. R.; CAMARGO-BRUNETTO, M. A. de O.; BINNECK, E. |
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Afiliação: |
PAULO R. SILLA, UEL; MARIA ANGÉLICA DE O. CAMARGO-BRUNETTO, UEL; ELISEU BINNECK, CNPSO. |
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Título: |
Using a support vector machine to identify Pre-miRNAs in soybean (Glycine max) introns. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS DESIGN AND APPLICATIONS, 2010, Cairo. Proceedings... [Cairo]: IEEE, 2010. CD-ROM. |
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Páginas: |
P. 1235-1241. |
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ISBN: |
978-1-4244-8135-4 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
MicroRNAs (miRNAs) are small Ribonucleic Acid (RNA) molecules ?18?22 nucleotides (nt) in length that regulates gene expression in animals, plants and viruses. Due to its small size and occurrence in different development stages of organisms, the experimental identification of miRNAs becomes difficult, and computational approaches are being developed in order to precede and guide biological experiments. This paper describes our approach based on a Support Vector Machine (SVM) algorithm to identify miRNA?s precursor (pre-miRNA) in soybean (Glycine max) transcript introns, that was developed using a secondary structure predictor of pre-miRNAs sequences to establish the feature set for training, testing and validation phases of SVM algorithm. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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245 $aUsing a support vector machine to identify Pre-miRNAs in soybean (Glycine max) introns.
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300 $aP. 1235-1241.
520 $aMicroRNAs (miRNAs) are small Ribonucleic Acid (RNA) molecules ?18?22 nucleotides (nt) in length that regulates gene expression in animals, plants and viruses. Due to its small size and occurrence in different development stages of organisms, the experimental identification of miRNAs becomes difficult, and computational approaches are being developed in order to precede and guide biological experiments. This paper describes our approach based on a Support Vector Machine (SVM) algorithm to identify miRNA?s precursor (pre-miRNA) in soybean (Glycine max) transcript introns, that was developed using a secondary structure predictor of pre-miRNAs sequences to establish the feature set for training, testing and validation phases of SVM algorithm.
653 $aBioinformática
700 1 $aCAMARGO-BRUNETTO, M. A. de O.
700 1 $aBINNECK, E.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 4 | |
| 1. |  | VITORINO, J. C.; SILLA, P. R.; CAMARGO-BRUNETTO, M. A. de.; BINNECK, E. Abordagem computacional para a identificação de elementos cis-regulatórios no genoma da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 95-97. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 2. | | VITORINO, J. C.; SILLA, P. R.; CAMARGO-BRUNETTO, M. A. de.; BINNECK, E. Abordagem computacional para a identificação de elementos cis-regulatóriso no genoma da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 95-97. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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